Ответ:
Для социальных налоговых вычетов, указанные в подпунктах 2-5 пункта 1 статьи 219 НК РФ (на образование, на лечение, на негосударственное пенсионное обеспечение, на накопительную часть трудовой пенсии), установлен общий предельный размер не более 120 тыс. руб. в налоговом периоде (календарный год). Налогоплательщик самостоятельно выбирает, какие виды расходов и в каких суммах учитываются в пределах указанной максимальной величины налогового вычета.

ОТВЕТ:
Социальные налоговые вычеты (к чему относится и вычет на лечение) предоставляются налогоплательщику на основании декларации по налогу на доходы физических лиц

по окончании соответствующего налогового периода и всех необходимых документов. Наличными деньгами налоговые органы вычет не предоставляют. Денежные средства как правило, поступают на счет налогоплательщика, инспекция просит открыть сберкнижку, куда перечиляются деньги за вычет.

ФНС России в письме от 25.08.06 N 04-2-01/13 разъяснила, что в вычет может быть включена стоимость дорогостоящих материалов для лечения (например, протезов и т.п.), которые оплатил пациент. При этом не имеет значения, платным или бесплатным было само лечение.
Согласно вышеуказанному письму «ФНС России при рассмотрении подобных случаев рекомендует налоговым органам учитывать в составе расходов по дорогостоящим видам лечения стоимость оплаченных налогоплательщиком необходимых дорогостоящих расходных материалов, если сама медицинская организация таковыми не располагает, и соответствующим договором с медицинской организацией предусмотрено их приобретение за счет средств пациента.
В данной ситуации как ваша, где «аппарат» приобретен не у медицинской организации, в которой проводилось лечение, а куплен у сторонней организации медицинское учреждение не может выдать справку по необходимой форме.
В таком случае рекомендуется сделать выписной эпикриз или выписка из истории болезни, подтверждающая использование приобретенных материалов при проведении дорогостоящего лечения. Такие разъяснения дают столичные налоговики в письмах от 23.03.2009 N 20-14/4/026195@, от 08.09.2008 N 28-10/085806@, от 07.02.2007 N 04-2-02/105@, от 23.12.2005 N 28-10/95327.
Считаю, не будет лишним распечатать письма ФНС и приложить к выписке из истории болезни. Факт передачи доп. документов оформляйте письменно.